Už takmer rok sú zapojení profesionálni vojaci zásobovacej základne do plnenia úloh na podporu pri zvládaní krízovej situácie súvisiacej s pandémiou COVID-19. Profesionálni vojaci po plošnom testovaní z konca minulého roka a skríningovom testovaní sú aj naďalej vyčleňovaní do mobilných odberových tímov, kde plnia úlohy koordinátorov odberného miesta v súlade s požiadavkami samospráv.

V priestoroch odlúčenej časti základne  v Centre zásob Poprad bolo od decembra 2020 do apríla 2021 zriadené mobilné odberové miesto,  v ktorom už doteraz otestovali viac ako 15 000 občanov. Od 8. marca do 30. apríla 2021 základňa vyčleňovala podľa požiadaviek Policajného zboru SR profesionálnych vojakov na plnenie asistenčných úloh v zmiešaných hliadkach, ktoré dohliadali na dodržiavanie vládou SR nariadených opatrení. Ďalšia z úloh, ktorú plnia PrV základne, je vyčlenenie príslušníkov Centra podpory Trenčín do vakcinačného centra Vojenskej polikliniky MO SR Trenčín, kde plnia administratívne úlohy spojené s registráciou osôb.